Prognostic significance of SCARA5 methylation in adjuvant chemotherapy for resectable non-small cell lung cancer

doi:10.3877/cma.j.issn.1674-6902.2024.06.015

Abstract

Abstract:

Objective

To analyze prognostic significance of scavenger receptor class A member 5（SCARA5） methylation in adjuvant chemotherapy （ACT） for non-small cell lung cancer （NSCLC）.

Methods

All of 69 patients with stage ⅠA～ⅢA NSCLC admitted to our hospital from May 2018 to January 2023 were selected as subjects.The methylation level of SCARA5 was detected by targeted bisulfite sequencing and realtime quantitative methylation-specific polymerase chain reaction （ RQ-MSP ）.Real-time fluorescence quantitative polymerase chain reaction （qRT-PCR） was used to detect SCARA5 mRNA levels and Spearman was used to analyze the correlation. Kaplan-Meier survival curve and COX risk proportional model were used to analyze the effect of SCARA5 methylation on prognosis.

Results

The methylation level of SCARA5 in NSCLC tumor tissue was 9.32（7.59，10.80） and 7.45 （6.36，8.55），respectively.SCARA5 mRNA in tumor tissue 3.22（2.86，4.14） was lower than that in paracancer tissue4.01 （3.53，4.46）（P ＜0.05）.SCARA5 hypermethylation （median ≥9.32） at 6 months，9 months，12 months relative dose intensity （relative dose intensity，RDI≥70% in 20 （57.14%），16 （45.71%），13 （19.12%） were lower than those in SCARA5 hypomethyl group 28（82.35%），28（82.35%），24（35.29%）（P＜0.05）.There were 30 cases （43.48%） with recurrence，and the median relapse-free survival was 21.00months.The follow-up was 28.00months，and 28 cases （40.58%） died.COD analysis showed that SCARA5 methylation was correlated with OS［HR：3.503（95%CI：1.327-9.248）］ and DFS［HR：2.393（95%CI：1.075-5.329）］ of ACT after NSCLC.The methylation level of SCARA5 in tumor tissue was negatively correlated with the mrna level of ScarA5 （Rho=-0.254， P=0.035）.SCARA5 hypermethylated DFS 40.00% was lower than SCARA5 hypomethylated DFS 73.53%，and SCARA5 hypermethylated OS 37.14% was lower than SCARA5 hypomethylated OS 82.35%（P ＜0.05）.

Conclusion

Hypermethylation of SCARA5 in resectable NSCLC after ACT has a poor prognosis，and SCARA5 can be a prognostic indicator of NSCLC.

Key words: Non-small cell lung cancer, Class A scavenger receptor type 5, Adjuvant chemotherapy, Prognosis

Mi Jiao, Yahuan Guo, Lian Duan, Fang Fang. Prognostic significance of SCARA5 methylation in adjuvant chemotherapy for resectable non-small cell lung cancer[J]. Chinese Journal of Lung Diseases(Electronic Edition), 2024, 17(06): 936-941.

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Figures/Tables 5

References 32

1	韦森.可切除非小细胞肺癌新辅助免疫治疗应用现状及进展［J］.癌症，2020，39（3）：95-103.
2	王园，杨懿，牟云飞，等.可切除非小细胞肺癌患者术后奥西替尼靶向治疗分析［J/CD］.中华肺部疾病杂志（电子版），2022，15（5）：657-660.
3	Chaft JE，Shyr Y，Sepesi B，et al.Preoperative and postoperative systemic therapy for operable non-small-cell lung cancer［J］.J Clin Oncol，2022，40（6）：546-555.
4	Ou W，Li N，Wang BX，et al.Adjuvant icotinib versus observation in patients with completely resected EGFR-mutated stage IB NSCLC（GASTO1003，CORIN）：a randomised，open-label，phase 2 trial［J］.EClinicalMedicine，2023，57：101839.
5	Freitas AJA，Causin RL，Varuzza MB，et al.Molecular biomarkers predict pathological complete response of neoadjuvant chemotherapy in breast cancer patients［J］.Cancers，2021，13（21）：5477-5493.
6	Constâncio V，Nunes SP，Henrique R，et al.DNA methylationbased testing in liquid biopsies as detection and prognostic biomarkers for the four major cancer types［J］.Cells，2020，9（3）：624.
7	Müller D，Györffy B.DNA methylation-based diagnostic，prognostic，and predictive biomarkers in colorectal cancer［J］.Biochim Biophys Acta Rev Cancer，2022，1877（3）：188722.
8	Dhar GA，Saha S，Mitra P，et al.DNA methylation and regulation of gene expression：Guardian of our health［J］.Nucleus，2021，64（3）：259-270.
9	Kiselev IS，Kulakova OG，Boyko AN，et al.DNA methylation as an epigenetic mechanism in the development of multiple sclerosis［J］.Acta Naturae，2021，13（2）：45.
10	Jiang X，Jiang Y，An D，et al.Methylated tumor suppressor gene SCARA5 inhibits the proliferation，migration and invasion of nasopharyngeal carcinoma［J］.Epigenomics，2023，15（11）：635-650.
11	Flockerzi FA，Hohneck J，Saar M，et al.SCARA5 is overexpressed in prostate cancer and linked to poor prognosis［J］.Diagnostics，2023，13（13）：2211.
12	Wieder R.Fibroblasts as turned agents in cancer progression［J］.Cancers，2023，15（7）：2014.
13	刘宝刚，李磊强，孙立哲，等.生物免疫疗法联合放化疗对NSCLC 患者CD3⁺、CD4⁺/CD8⁺、NK 的影响［J/CD］.中华肺部疾病杂志（电子版），2023，16（5）：661-663.
14	陈旭，牛凯，孙建国.放疗联合免疫治疗对驱动基因阴性NSCLC 的困惑分析及应对策略［J/CD］.中华肺部疾病杂志（电子版），2024，17（3）：341-348.
15	李梦琦，杨丽.青年肺癌的诊断、分子遗传学特点及治疗研究进展［J］.山东医药，2023，63（23）：89-92.
16	Liu J，Huang B，Ding F，et al.Environment factors，DNA methylation，and cancer［J］.Environmental Geochemistry and Health，2023，45（11）：7543-7568.
17	Ramazi S，Dadzadi M，Sahafnejad Z，et al.Epigenetic regulation in lung cancer［J］.MedComm，2023，4（6）：e401.
18	Mattei AL，Bailly N，Meissner A.DNA methylation：a historical perspective.Trends Genet［J］.2022，38（7）：676-707.
19	Goldmann T，Schmitt B，Müller J，et al.DNA methylation profiles of bronchoscopic biopsies for the diagnosis of lung cancer［J］.Clin Epigenetics，2021，13（1）：38.
20	Li Y，Fan Z，Meng Y，et al.Blood-based DNA methylation signatures in cancer：A systematic review［J］.Biochim Biophys Acta Mol Basis Dis，2023，1869（1）：166583.
21	薛剑超，王亚东，李博文，等.DNA 甲基化在肺癌发生及预后中作用的研究进展［J］.基础医学与临床，2023，43（3）：514-518.
22	Zhang H，Liu C，Wang X，et al.SCARA5 inhibits gastric cancer progression via epithelial-mesenchymal transition suppression［J］.J Cancer，2021，12（8）：2412.
23	Zhang H，Liu C，Wang X，et al.SCARA5 inhibits gastric cancer progression via epithelial-mesenchymal transition suppression［J］.J Cancer，2021，12（8）：2412-2421.
24	Liu Y，Xiong R，Xiao T，et al.SCARA5 induced ferroptosis to effect ESCC proliferation and metastasis by combining with Ferritin light chain［J］.BMC Cancer，2022，22（1）：1304.
25	Huang J，Lv C，Zhao B，et al.SCARA5 inhibits oral squamous cell carcinoma via inactivating the STAT3 and PI3K/AKT signaling pathways［J］.Open Med （Wars），2023，18（1）：20230627.
26	Ni Q，Li X，Huang H，et al.Decreased expression of SCARA5 predicts a poor prognosis in melanoma using bioinformatics analysis［J］.Front Oncol，2023，13：1015358.
27	Zhang C，Zhang J，Guo K.Paeonol upregulates expression of tumor suppressors TNNC1 and SCARA5，exerting anti-tumor activity in non-small cell lung cancer cells［J］.Naunyn Schmiedebergs Arch Pharmacol，Published online January 24，2024.
28	Peng Q，Liu Y，Kong X，et al.The novel methylation biomarker SCARA5 sensitizes cancer cells to DNA damage chemotherapy drugs in NSCLC［J］.Front Oncol，2021，11：666589.
29	Chaft JE，Rimner A，Weder W，et al.Evolution of systemic therapy for stages Ⅰ-Ⅲnon-metastatic non-small-cell lung cancer［J］.Nat Rev Clin Oncol，2021，18（9）：547-557.
30	Okumura N，Soh J，Suzuki H，et al.Randomized phase Ⅱstudy of daily and alternate-day administration of S-1 for adjuvant chemotherapy in completely-resected stage I non-small cell lung cancer：results of the Setouchi Lung Cancer Group Study 1301［J］.BMC Cancer，2021，21（1）：506.
31	amamoto H，Soh J，Okumura N，et al.Randomized phase Ⅱstudy of daily versus alternate-day administrations of S-1 for the elderly patients with completely resected pathological stage Ⅳ （tumor diameter ＞2 cm）-ⅢA of non-small cell lung cancer：Setouchi Lung Cancer Group Study 1201 ［J］.PLoS One，2023，18 （5）：e0285273.
32	Kayashima H，Itoh S，Shimokawa M，et al.Effect of duration of adjuvant chemotherapy with S-1 （6 versus 12 months） for resected pancreatic cancer：the multicenter clinical randomized phase Ⅱpostoperative adjuvant chemotherapy S-1 （PACS-1） trial［J］.Int J Clin Oncol，2023，28（11）：1520-1529.

SCARA5引物	正向（5’-3’）	反向（5’-3’）
甲基化引物	GAATCGGTTGAATGAGAGTTTTC	AATCTAACTAATTCTCAACGCGTC
未甲基化引物	GTGAATTGGTTGAATGAGAGTTTTT	AATCTAACTAATTCTACAACACATC
qRT-PCR引物	ATCTCTCCCAGGTACCACCC	CCTCAGAGAGGGCGTTTTGT

SCARA5引物	正向（5’-3’）	反向（5’-3’）
甲基化引物	GAATCGGTTGAATGAGAGTTTTC	AATCTAACTAATTCTCAACGCGTC
未甲基化引物	GTGAATTGGTTGAATGAGAGTTTTT	AATCTAACTAATTCTACAACACATC
qRT-PCR引物	ATCTCTCCCAGGTACCACCC	CCTCAGAGAGGGCGTTTTGT

临床资料	SCARA5高甲基化（n=35）	SCARA5低甲基化（n=34）	χ²/t/Z	P值
TNM分期			3.376	0.066
1	16（45.71）	23（67.65）
2～3	19（54.29）	11（32.35）
LNM	22（62.86）	17（50.00）	1.160	0.281
腺癌	21（60.00）	26（76.47）	2.154	0.142
吸烟史	26（74.29）	21（61.76）	1.245	0.265
手术时长（min）	193.20±60.89	186.47±71.08	0.423	0.674
术中失血量（ml）	40.00（10.00，125.00）	42.50（5.00，115.00）	-0.042	0.966
完成ACT	11（31.43）	12（35.29）	0.116	0.734
6个月RDI≥70%	20（57.14）	28（82.35）	5.177	0.023
9个月RDI≥70%	16（45.71）	28（82.35）	10.020	0.002
12个月RDI≥70%	13（19.12）	24（35.29）	7.173	0.007

临床资料	SCARA5高甲基化（n=35）	SCARA5低甲基化（n=34）	χ²/t/Z	P值
TNM分期			3.376	0.066
1	16（45.71）	23（67.65）
2～3	19（54.29）	11（32.35）
LNM	22（62.86）	17（50.00）	1.160	0.281
腺癌	21（60.00）	26（76.47）	2.154	0.142
吸烟史	26（74.29）	21（61.76）	1.245	0.265
手术时长（min）	193.20±60.89	186.47±71.08	0.423	0.674
术中失血量（ml）	40.00（10.00，125.00）	42.50（5.00，115.00）	-0.042	0.966
完成ACT	11（31.43）	12（35.29）	0.116	0.734
6个月RDI≥70%	20（57.14）	28（82.35）	5.177	0.023
9个月RDI≥70%	16（45.71）	28（82.35）	10.020	0.002
12个月RDI≥70%	13（19.12）	24（35.29）	7.173	0.007

影响因素	β	SE	瓦尔德	P值	HR（95%CI）
单因素
男性（是 vs. 否）	0.213	0.433	0.243	0.622	1.238（0.530～2.890）
年龄≥71岁	0.024	0.366	0.004	0.948	1.024（0.500～2.096）
BMI≥23.14 kg/m²	-0.065	0.366	0.031	0.860	0.937（0.457～1.922）
TNM Ⅰ期（是 vs. 否）	-1.117	0.380	8.639	0.003	0.327（0.155～0.689）
LNM（是 vs. 否）	0.777	0.400	3.768	0.052	2.175（0.992～4.767）
腺癌（是 vs. 否）	-0.444	0.370	1.440	0.230	0.642（0.311～1.325）
吸烟史（是 vs. 否）	-0.064	0.399	0.025	0.874	0.938（0.429～2.051）
手术时长≥196 min（是 vs. 否）	0.161	0.374	0.186	0.666	1.175（0.565～2.445）
失血量≥40 ml（是 vs. 否）	0.544	0.390	1.944	0.163	1.723（0.802～3.703）
完成ACT（是 vs. 否）	-0.295	0.414	0.508	0.476	0.745（0.331～1.675）
6个月RDI≥70%（是 vs. 否）	-0.287	0.388	0.547	0.459	0.751（0.351～1.605）
9个月RDI≥70%（是 vs. 否）	-0.407	0.369	1.215	0.270	0.666（0.323～1.372）
12个月RDI≥70%（是 vs. 否）	-0.530	0.370	2.049	0.152	0.589（0.285～1.216）
SCARA5高甲基化（是 vs. 否）	1.077	0.400	7.250	0.007	2.935（1.34～6.429）
多因素TNM Ⅰ期（是 vs. 否）	-0.931	0.388	5.743	0.017	0.394（0.184～0.844）
SCARA5高甲基化（是 vs. 否）	0.873	0.408	4.565	0.033	2.393（1.075～5.329）

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