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中华肺部疾病杂志(电子版)

中华肺部疾病杂志(电子版) ›› 2019, Vol. 12 ›› Issue (05) : 559 -562. doi: 10.3877/cma.j.issn.1674-6902.2019.05.005

论著

多重实时荧光定量PCR对下呼吸道感染病原体检测分析
刘馨玉1, 李萌1, 石璞玉1, 陈明伟1,†()   
  1. 1. 710061　西安，西安交通大学第一附属医院
  • 收稿日期:2019-05-11 出版日期:2019-10-20
  • 通信作者: 陈明伟
  • 基金资助:
    国家科技重大专项课题资助(2017ZX10103004)

Detection and analysis of multiplex real-time polymerase chain reaction assay of pathogens in lower respiratory tract infections

Xinyu Liu1, Meng Li1, Puyu Shi1, Mingwei Chen1,†()   

  1. 1. Department of Respiratory Medicine, First Affiliated Hospital of Xi′an Jiaotong University, Xi′an 710061, China
  • Received:2019-05-11 Published:2019-10-20
  • Corresponding author: Mingwei Chen
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引用本文：

刘馨玉, 李萌, 石璞玉, 陈明伟. 多重实时荧光定量PCR对下呼吸道感染病原体检测分析[J]. 中华肺部疾病杂志(电子版), 2019, 12(05): 559-562.

Xinyu Liu, Meng Li, Puyu Shi, Mingwei Chen. Detection and analysis of multiplex real-time polymerase chain reaction assay of pathogens in lower respiratory tract infections[J]. Chinese Journal of Lung Diseases(Electronic Edition), 2019, 12(05): 559-562.

目的

比较多重实时荧光定量PCR(multiplex real-time polymerase chain reaction, MRT-PCR)和间接免疫荧光法(indirect immunofluorescence assay, IFA)对成人呼吸道病毒及非典型病原体检测结果。

方法

收集2014年1月至2017年12月间呼吸内科210例成人呼吸道感染的标本，采用MRT-PCR检测8种常见呼吸道病原体，同时应用IFA检测血清8种病原体IgM抗体，并全部进行PCR及测序分析，比较两种方法的特异性及敏感性，评估MRT-PCR的临床应用价值。

结果

210例下呼吸道感染标本经MRT-PCR和IFA检测，阳性率分别为58.57%和38.10%，混合感染率分别为7.62%和4.76%。两种方法的灵敏度分别为94.74%和35.96%，特异度分别为84.38%和59.38%。灵敏度和特异度差异有统计学意义(P<0.05)。

结论

与IFA相比，MRT-PCR灵敏度、特异度好，检测性能优于IFA。

关键词: 下呼吸道感染, 呼吸道病毒, 非典型病原体, 间接免疫荧光法, 多重实时荧光定量PCR
Objective

To compare the detection results of the samples from the patients with lower respiratory tract infections with multiplex real-time polymerase chain reaction (PCR) assay (MRT-PCR) and indirect immunofluorescence assay (IFA).

Methods

The samples of the infected lower respiratory tract were taken from 210 patients in our hospital during January 2014 to December 2017. The samples were detected by MRT-PCR and IFA, respectively, and then received sequencing analysis. Then the sensitivity and specificity of the two kinds of assays were compared.

Results

The positive rates of the pathogens in the 210 samples for the MRT-PCR and IFA were 58.57% and 38.10%, respectively, and the mixed infection rates were 7.62% and 4.76%, respectively. The sensitivities for the MRT-PCR and IFA were 94.74% and 35.96%, respectively, and the specificities for the MRT-PCR and IFA were 84.38% and 59.38%, respectively. There were significant differences in the sensitivities and specificities of the two kinds of assays (P<0.05).

Conclusion

Compared with the IFA assay, the MRT-PCR assay has a higher sensitivity and a higher specificity in the detection of the pathogens in the lower respiratory tract infections.

Key words: Lower respiratory tract infections, Respiratory virus, Atypical pathogen, Indirect immunofluorescence assay, Multiplex real-time polymerase chain reaction
表1 MRT-PCR法与IFA法检测结果比较
病原体 MRT-PCR IFA
TP FP FN TN 灵敏度(%) 特异度(%) PPV(%) NPV(%) TP FP FN TN 灵敏度(%) 特异度(%) PPV(%) NPV(%)
FluA 35 4 0 171 100.00 97.71 89.74 100.00 12 12 23 163 34.29 93.14 50.00 87.63
RSV 8 0 0 202 100.00 100.00 100.00 100.00 2 2 6 200 25.00 99.01 50.00 97.09
PIV 12 1 0 197 100.00 99.49 92.31 100.00 2 1 10 197 16.67 99.49 66.67 95.17
FluB 7 2 0 201 100.00 99.01 77.78 100.00 2 5 5 198 28.57 97.54 28.57 97.54
ADV 9 2 2 197 81.82 98.99 81.82 98.99 2 3 9 196 18.18 98.49 40.00 95.61
MP 40 6 3 161 93.02 96.41 86.96 98.17 17 14 26 153 39.53 91.62 54.84 85.47
CP 4 0 0 206 100.00 100.00 100.00 100.00 4 5 0 201 100.00 97.57 44.44 100.00
LP 9 0 1 200 90.00 100.00 100.00 99.50 4 3 6 197 40.00 98.50 57.14 97.04
表2 两种方法不一致标本测序结果
MRT-PCR IFA 测序 MRT-PCR IFA 测序 MRT-PCR IFA 测序
FluA+MP - FluA+MP PIV - PIV LP - LP
FluA+MP FluA FluA+MP PIV - - - FluA+RSV -
FluA+RSV - FluA+RSV FluB FluB+MP FluB - FluA -
FluB+MP - FluB+MP FluB - - - RSV -
FluB+RSV - FluB+RSV ADV LP ADV - FluB -
PIV+LP - PIV+LP ADV CP ADV - MP -
FluA MP FluA ADV - ADV - LP -
FluA LP+PIV FluA ADV - - - CP -
FluA FluA+MP FluA MP - MP - FluA+MP -
FluA - FluA MP FluA MP - ADV -
FluA - - MP - MP      
RSV FluA RSV MP - -      
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