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中华肺部疾病杂志(电子版)

中华肺部疾病杂志(电子版) ›› 2022, Vol. 15 ›› Issue (03) : 448 -450. doi: 10.3877/cma.j.issn.1674-6902.2022.03.047

病例报告

应用宏基因二代测序技术诊断胞内分枝杆菌型NTM肺病一例并文献复习
陈众众1, 闵凌峰2, 刘家昌1,†()   
  1. 1. 232001　淮南，安徽理工大学第一附属医院（淮南市第一人民医院）呼吸与危重症医学科
    2. 225001　江苏，大连医科大学附属苏北医院，扬州大学医学院附属苏北人民医院呼吸与危重症医学科
  • 收稿日期:2021-10-13 出版日期:2022-06-25
  • 通信作者: 刘家昌
  • 基金资助:
    国家自然科学基金资助项目(81870033)

Metagenomic next-Generation sequencing technology for diagnosis of non-tuberculous mycobacterial Infections: a case report and literature review

Zhongzhong Chen1, Lingfeng Min2, Jiachang Liu1()   

  • Received:2021-10-13 Published:2022-06-25
  • Corresponding author: Jiachang Liu
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引用本文：

陈众众, 闵凌峰, 刘家昌. 应用宏基因二代测序技术诊断胞内分枝杆菌型NTM肺病一例并文献复习[J]. 中华肺部疾病杂志(电子版), 2022, 15(03): 448-450.

Zhongzhong Chen, Lingfeng Min, Jiachang Liu. Metagenomic next-Generation sequencing technology for diagnosis of non-tuberculous mycobacterial Infections: a case report and literature review[J]. Chinese Journal of Lung Diseases(Electronic Edition), 2022, 15(03): 448-450.

结核病是由结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)复合群感染引起的传染性疾病，我国结核发病率居高不下，居全球第二位[1,2,3]。及时控制传染源，快速诊断结核病是防治结核病的关键。随着结核病疫情逐步得到控制，非结核分枝杆菌(non-Tuberculosis Mycobacterium, NTM)的感染在全球范围内呈上升趋势[4,5,6]。NTM肺病与结核病临床表现相似，痰抗酸染色均阳性，易误诊为结核病。NTM肺病与结核病治疗方案迥异，需及时鉴别NTM肺病与结核病。精确鉴定分枝杆菌菌种是诊治NTM病与结核病的关键。宏基因组二代测序技术(metagenomic next-generation sequencing, mNGS)是一种对病原菌脱氧核糖核酸含量进行高通量测序的技术，能够精确诊断病原微生物，对特殊菌群及疑难病例的罕见致病菌的检测具有速度快、阳性率高等优势[7,8]。我们报道1例利用mNGS技术将误诊为结核病患者诊断为胞内分枝杆菌型NTM肺病，并复习国内外相关文献对mNGS在非结核分枝杆菌中诊断及应用价值进行分析，报告如下。

关键词: 非结核分枝杆菌, 结核分枝杆菌, 宏基因二代测序, 感染
图1 患者胸部CT检查结果；注：A、B：为2月17肺部CT提示：右上肺密实影伴支气管扩张及空洞，考虑感染性病变；C、D：为7月28肺部CT提示：右上肺密实影伴支气管扩张及空洞，较2月17变化不大
表1 患者肺泡灌洗液样本中检测出的微生物列表(%)
种(中文名) 属(中文名) 检出序列数 基因组覆盖度
分枝杆菌 胞内分枝杆菌属 31447 44.07
扩展青霉菌 扩展青霉菌属 38 0.02
1
方源扬，刘国强，黄显聪，等. 景东县2004-2013年肺结核防治的卫生经济学分析[J/CD]. 中华肺部疾病杂志(电子版), 2016, 9(1): 36-40.
2
任成山，林　辉，杨仕明. 结核病的流行特征与耐多药的窘迫及其策略[J/CD]. 中华肺部疾病杂志(电子版), 2019, 12(3): 269-274.
3
Harding E. WHO global progress report on tuberculosis elimination[J]. Lancet Respir Med, 2020, 8(1): 19.
4
Getahun A, Stapleton Jack-T, Rouphael N, et al. Variability in the management of adults with pulmonary nontuberculous mycobacterial disease[J]. Clin Infect Dis, 2021, 72(7): 1127-1137.
5
储美萍，钱　超，赵新国，等. 老年支气管扩张合并非结核分枝杆菌感染的临床特征及其危险因素[J]. 中华医院感染学杂志，2021, 31(1): 48-52.
6
To K, Cao RQ, Yegiazaryan A, et al. General overview of nontuberculous mycobacteria opportunistic pathogens: Mycobacterium avium and mycobacterium abscessus[J]. J Clin Med, 2020, 9(8): 2541.
7
辜吉秀，李　晴，马　玲，等. 高通量二代测序技术在耐药结核病诊断中的应用[J]. 中国防痨杂志，2020, 42(11): 1203-1208.
8
沈　轶，潘　雁，尹成胜，等. 二代测序诊断肺移植后耶氏肺孢子菌肺炎二例并文献复习[J]. 中国呼吸与危重监护杂志，2021, 20(7): 479-486.
9
Shi CL, Han P, Tang PJ, et al. Clinical metagenomic sequencing for diagnosis of pulmonary tuberculosis[J]. J Infect, 2020, 81(4): 567-574.
10
Zhu H, Zhu M, Lei JH, et al. Metagenomic next-generation sequencing can clinch diagnosis of non-tuberculous mycobacterial infections: A case report[J]. Front Med (Lausanne), 2021, 8679755.
11
王马艳，刘　华，王小军，等. 通过二代基因测序技术诊断非结核分枝杆菌肺病1例并文献复习[J]. 安徽医学，2020, 41(5): 610-611.
12
黄畅宇，胡瑞成，张有志，等. 应用二代测序技术诊断肺结核病及肺非结核分枝杆菌病各一例并文献复习[J]. 中国呼吸与危重监护杂志，2019, 18(1): 21-25.
13
马潇枭，高宝安，牟　干，等. 利用宏基因组测序确诊肺结核及非结核分枝杆菌肺病各一例报道并文献复习[J]. 实用心脑肺血管病杂志，2021, 29(1): 122-127.
14
缪　青，姚雨濛，潘　珏，等. 宏基因二代测序技术对非结核分枝杆菌感染病原学诊断的价值[J]. 中国临床医学，2020, 27(4): 559-562.
15
Matsumoto Y, Kinjo T, Motooka D, et al. Comprehensive subspecies identification of 175 nontuberculous mycobacteria species based on 7547 genomic profiles[J]. Emerg Microbes Infect, 2019, 8(1): 1043-1053.
16
Daley CL, Iaccarino JM, Lange C, et al. Treatment of nontuberculous mycobacterial pulmonary disease: an official ATS/ERS/ESCMID/IDSA clinical practice guideline[J]. Eur Respir J, 2020, 56(1): 2000535.
17
Yu X, Liu P, Liu G, et al. The prevalence of non-tuberculous mycobacterial infections in mainland China: Systematic review and meta-analysis[J]. J Infect, 2016, 73(6): 558-567.
18
李远春，张　越，曾祥洁，等. 胞内分枝杆菌临床分离株亚种组成及体外耐药性分析[J]. 中国防痨杂志，2021, 43(2): 147-152.
19
Daley CL, Iaccarino JM, Lange C, et al. Treatment of nontuberculous mycobacterial pulmonary disease: An official ATS/ERS/ESCMID/IDSA clinical practice guideline[J]. Clin Infect Dis, 2020, 71(4): e1-e36.
20
陈品儒，谭守勇. 非结核分枝杆菌肺病合并气管支气管结核样病变89例临床特点分析[J]. 中华结核和呼吸杂志，2020, 43(11): 947-952.
21
钮月英，吴晓虹，应可净. 肺泡灌洗液宏基因二代测序技术对下呼吸道感染病原体检测的优势[J]. 中国实用内科杂志，2020, 40(9): 754-758.
22
谢栓栓，李　譞，李　萍，等. 宏基因二代测序技术对感染性疾病患者的诊断价值及其临床应用[J]. 国际呼吸杂志，2020, 40(9): 641-646.
[1] 农云洁, 黄小桂, 黄裕兰, 农恒荣. 超声在多重肺部感染诊断中的临床应用价值[J]. 中华医学超声杂志（电子版）, 2024, 21(09): 872-876.
[2] 姜珊, 李湘燕, 田硕涵, 温冰, 何睿, 齐心. 采用优化抗感染治疗模式改善糖尿病足感染预后的临床观察[J]. 中华损伤与修复杂志(电子版), 2024, 19(05): 398-403.
[3] 崔子豪, 阳跃, 赵景峰, 冯光, 庹晓晔. Fournier坏疽创面感染控制策略及创面修复的临床分析[J]. 中华损伤与修复杂志(电子版), 2024, 19(04): 319-323.
[4] 张升荣, 李晓东, 王伟. B族链球菌感染分型对孕产妇未足月胎膜早破的预测价值及其与绒毛膜羊膜炎的关系[J]. 中华实验和临床感染病杂志(电子版), 2024, 18(03): 170-175.
[5] 卢铭浩, 李红, 侯本祥. 根尖生物膜清除方法的研究进展[J]. 中华口腔医学研究杂志(电子版), 2024, 18(04): 257-261.
[6] 梁孟杰, 朱欢欢, 王行舟, 江航, 艾世超, 孙锋, 宋鹏, 王萌, 刘颂, 夏雪峰, 杜峻峰, 傅双, 陆晓峰, 沈晓菲, 管文贤. 联合免疫治疗的胃癌转化治疗患者预后及术后并发症分析[J]. 中华普外科手术学杂志(电子版), 2024, 18(06): 619-623.
[7] 许月芳, 刘旺, 曾妙甜, 郭宇姝. 多粘菌素B和多粘菌素E治疗外科多重耐药菌感染临床疗效及安全性分析[J]. 中华普外科手术学杂志(电子版), 2024, 18(06): 700-703.
[8] 丁关棣, 黄云, 曹震, 刘刚. 胃癌根治术后感染性并发症预测：基于真实世界数据的Nomogram模型开发与验证[J]. 中华普外科手术学杂志(电子版), 2024, 18(03): 261-266.
[9] 陈冬丽, 邓迎丽, 毕婧. α-干扰素治疗急性呼吸道病毒感染对Th1/Th2平衡及肺功能的影响[J]. 中华肺部疾病杂志(电子版), 2024, 17(04): 590-594.
[10] 刘静, 徐爽, 缪亚军. 肺腺癌miR-3653表达与高危型人乳头瘤病毒感染及预后的关系[J]. 中华肺部疾病杂志(电子版), 2024, 17(04): 600-604.
[11] 郑玉, 许振浪, 陈青青. 类鼻疽致肺部感染患者的治疗及药学监护分析一例[J]. 中华肺部疾病杂志(电子版), 2024, 17(04): 670-672.
[12] 孙晓容, 刘佳铭, 刘禹. 以单侧肺起病的继发性重症间质性肺病的综合管理一例[J]. 中华肺部疾病杂志(电子版), 2024, 17(03): 499-501.
[13] 于泽, 隋宇航, 孙备. 坏死性胰腺炎相关并发症外科干预策略[J]. 中华肝脏外科手术学电子杂志, 2024, 13(04): 450-455.
[14] 周祥, 张庆庆, 张雪琴, 王晓宇, 姜鸿. Meta分析庆大霉素封管液预防血透患者中心静脉导管相关感染[J]. 中华肾病研究电子杂志, 2024, 13(04): 201-206.
[15] 丛黎, 马林, 陈旭, 李文文, 张亮亮, 周华亭. 改良CT严重指数联合炎症指标在重症急性胰腺炎患者胰腺感染预测及预后评估中的研究[J]. 中华消化病与影像杂志(电子版), 2024, 14(05): 432-436.
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