切换至 "中华医学电子期刊资源库"

中华肺部疾病杂志(电子版) ›› 2022, Vol. 15 ›› Issue (03) : 448 -450. doi: 10.3877/cma.j.issn.1674-6902.2022.03.047

病例报告

应用宏基因二代测序技术诊断胞内分枝杆菌型NTM肺病一例并文献复习
陈众众1, 闵凌峰2, 刘家昌1,()   
  1. 1. 232001 淮南,安徽理工大学第一附属医院(淮南市第一人民医院)呼吸与危重症医学科
    2. 225001 江苏,大连医科大学附属苏北医院,扬州大学医学院附属苏北人民医院呼吸与危重症医学科
  • 收稿日期:2021-10-13 出版日期:2022-06-25
  • 通信作者: 刘家昌
  • 基金资助:
    国家自然科学基金资助项目(81870033)

Metagenomic next-Generation sequencing technology for diagnosis of non-tuberculous mycobacterial Infections: a case report and literature review

Zhongzhong Chen1, Lingfeng Min2, Jiachang Liu1()   

  • Received:2021-10-13 Published:2022-06-25
  • Corresponding author: Jiachang Liu
引用本文:

陈众众, 闵凌峰, 刘家昌. 应用宏基因二代测序技术诊断胞内分枝杆菌型NTM肺病一例并文献复习[J]. 中华肺部疾病杂志(电子版), 2022, 15(03): 448-450.

Zhongzhong Chen, Lingfeng Min, Jiachang Liu. Metagenomic next-Generation sequencing technology for diagnosis of non-tuberculous mycobacterial Infections: a case report and literature review[J]. Chinese Journal of Lung Diseases(Electronic Edition), 2022, 15(03): 448-450.

结核病是由结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)复合群感染引起的传染性疾病,我国结核发病率居高不下,居全球第二位[1,2,3]。及时控制传染源,快速诊断结核病是防治结核病的关键。随着结核病疫情逐步得到控制,非结核分枝杆菌(non-Tuberculosis Mycobacterium, NTM)的感染在全球范围内呈上升趋势[4,5,6]。NTM肺病与结核病临床表现相似,痰抗酸染色均阳性,易误诊为结核病。NTM肺病与结核病治疗方案迥异,需及时鉴别NTM肺病与结核病。精确鉴定分枝杆菌菌种是诊治NTM病与结核病的关键。宏基因组二代测序技术(metagenomic next-generation sequencing, mNGS)是一种对病原菌脱氧核糖核酸含量进行高通量测序的技术,能够精确诊断病原微生物,对特殊菌群及疑难病例的罕见致病菌的检测具有速度快、阳性率高等优势[7,8]。我们报道1例利用mNGS技术将误诊为结核病患者诊断为胞内分枝杆菌型NTM肺病,并复习国内外相关文献对mNGS在非结核分枝杆菌中诊断及应用价值进行分析,报告如下。

图1 患者胸部CT检查结果;注:A、B:为2月17肺部CT提示:右上肺密实影伴支气管扩张及空洞,考虑感染性病变;C、D:为7月28肺部CT提示:右上肺密实影伴支气管扩张及空洞,较2月17变化不大
表1 患者肺泡灌洗液样本中检测出的微生物列表(%)
1
方源扬,刘国强,黄显聪,等. 景东县2004-2013年肺结核防治的卫生经济学分析[J/CD]. 中华肺部疾病杂志(电子版), 2016, 9(1): 36-40.
2
任成山,林 辉,杨仕明. 结核病的流行特征与耐多药的窘迫及其策略[J/CD]. 中华肺部疾病杂志(电子版), 2019, 12(3): 269-274.
3
Harding E. WHO global progress report on tuberculosis elimination[J]. Lancet Respir Med, 2020, 8(1): 19.
4
Getahun A, Stapleton Jack-T, Rouphael N, et al. Variability in the management of adults with pulmonary nontuberculous mycobacterial disease[J]. Clin Infect Dis, 2021, 72(7): 1127-1137.
5
储美萍,钱 超,赵新国,等. 老年支气管扩张合并非结核分枝杆菌感染的临床特征及其危险因素[J]. 中华医院感染学杂志2021, 31(1): 48-52.
6
To K, Cao RQ, Yegiazaryan A, et al. General overview of nontuberculous mycobacteria opportunistic pathogens: Mycobacterium avium and mycobacterium abscessus[J]. J Clin Med, 2020, 9(8): 2541.
7
辜吉秀,李 晴,马 玲,等. 高通量二代测序技术在耐药结核病诊断中的应用[J]. 中国防痨杂志2020, 42(11): 1203-1208.
8
沈 轶,潘 雁,尹成胜,等. 二代测序诊断肺移植后耶氏肺孢子菌肺炎二例并文献复习[J]. 中国呼吸与危重监护杂志2021, 20(7): 479-486.
9
Shi CL, Han P, Tang PJ, et al. Clinical metagenomic sequencing for diagnosis of pulmonary tuberculosis[J]. J Infect, 2020, 81(4): 567-574.
10
Zhu H, Zhu M, Lei JH, et al. Metagenomic next-generation sequencing can clinch diagnosis of non-tuberculous mycobacterial infections: A case report[J]. Front Med (Lausanne), 2021, 8679755.
11
王马艳,刘 华,王小军,等. 通过二代基因测序技术诊断非结核分枝杆菌肺病1例并文献复习[J]. 安徽医学2020, 41(5): 610-611.
12
黄畅宇,胡瑞成,张有志,等. 应用二代测序技术诊断肺结核病及肺非结核分枝杆菌病各一例并文献复习[J]. 中国呼吸与危重监护杂志2019, 18(1): 21-25.
13
马潇枭,高宝安,牟 干,等. 利用宏基因组测序确诊肺结核及非结核分枝杆菌肺病各一例报道并文献复习[J]. 实用心脑肺血管病杂志2021, 29(1): 122-127.
14
缪 青,姚雨濛,潘 珏,等. 宏基因二代测序技术对非结核分枝杆菌感染病原学诊断的价值[J]. 中国临床医学2020, 27(4): 559-562.
15
Matsumoto Y, Kinjo T, Motooka D, et al. Comprehensive subspecies identification of 175 nontuberculous mycobacteria species based on 7547 genomic profiles[J]. Emerg Microbes Infect, 2019, 8(1): 1043-1053.
16
Daley CL, Iaccarino JM, Lange C, et al. Treatment of nontuberculous mycobacterial pulmonary disease: an official ATS/ERS/ESCMID/IDSA clinical practice guideline[J]. Eur Respir J, 2020, 56(1): 2000535.
17
Yu X, Liu P, Liu G, et al. The prevalence of non-tuberculous mycobacterial infections in mainland China: Systematic review and meta-analysis[J]. J Infect, 2016, 73(6): 558-567.
18
李远春,张 越,曾祥洁,等. 胞内分枝杆菌临床分离株亚种组成及体外耐药性分析[J]. 中国防痨杂志2021, 43(2): 147-152.
19
Daley CL, Iaccarino JM, Lange C, et al. Treatment of nontuberculous mycobacterial pulmonary disease: An official ATS/ERS/ESCMID/IDSA clinical practice guideline[J]. Clin Infect Dis, 2020, 71(4): e1-e36.
20
陈品儒,谭守勇. 非结核分枝杆菌肺病合并气管支气管结核样病变89例临床特点分析[J]. 中华结核和呼吸杂志2020, 43(11): 947-952.
21
钮月英,吴晓虹,应可净. 肺泡灌洗液宏基因二代测序技术对下呼吸道感染病原体检测的优势[J]. 中国实用内科杂志2020, 40(9): 754-758.
22
谢栓栓,李 譞,李 萍,等. 宏基因二代测序技术对感染性疾病患者的诊断价值及其临床应用[J]. 国际呼吸杂志2020, 40(9): 641-646.
[1] 李培杰, 乔永杰, 张浩强, 曾健康, 谭飞, 李嘉欢, 王静, 周胜虎. 细菌培养阴性的假体周围感染诊治的最新进展[J]. 中华关节外科杂志(电子版), 2023, 17(06): 827-833.
[2] 涂家金, 廖武强, 刘金晶, 涂志鹏, 毛远桂. 严重烧伤患者鲍曼不动杆菌血流感染的危险因素及预后分析[J]. 中华损伤与修复杂志(电子版), 2023, 18(06): 491-497.
[3] 廖锵云, 王震, 林洁玉, 廖夏, 邓锦华, 李杰峰, 邓建维, 李明, 荣新洲. 虎门地区创伤弧菌感染的临床观察[J]. 中华损伤与修复杂志(电子版), 2023, 18(05): 394-398.
[4] 蔡柔妹, 曾洁梅, 黄伟丽, 谢文敏, 刘燕丹, 吴漫君, 蔡楚燕. 利用QC小组干预降低经烧伤创面股静脉置管导管相关性感染发生率的临床观察[J]. 中华损伤与修复杂志(电子版), 2023, 18(05): 399-404.
[5] 杨瑞洲, 李国栋, 吴向阳. 腹股沟疝术后感染的治疗方法探讨[J]. 中华疝和腹壁外科杂志(电子版), 2023, 17(06): 715-719.
[6] 徐金林, 陈征. 抗菌药物临床应用监测对腹股沟疝修补术预防用药及感染的影响[J]. 中华疝和腹壁外科杂志(电子版), 2023, 17(06): 720-723.
[7] 李静如, 王江玲, 吴向阳. 简易负压引流在腹股沟疝术后浅部感染中的疗效分析[J]. 中华疝和腹壁外科杂志(电子版), 2023, 17(06): 745-749.
[8] 李秉林, 吕少诚, 潘飞, 姜涛, 樊华, 寇建涛, 贺强, 郎韧. 供肝灌注液病原菌与肝移植术后早期感染的相关性分析[J]. 中华肝脏外科手术学电子杂志, 2023, 12(06): 656-660.
[9] 赵立力, 王魁向, 张小冲, 李志远. 血沉与C-反应蛋白比值在假体周围感染中的诊断价值分析[J]. 中华老年骨科与康复电子杂志, 2023, 09(06): 351-355.
[10] 卓少宏, 林秀玲, 周翠梅, 熊卫莲, 马兴灶. CD64指数、SAA/CRP、PCT联合检测在小儿消化道感染性疾病鉴别诊断中的应用[J]. 中华消化病与影像杂志(电子版), 2023, 13(06): 505-509.
[11] 李静静, 翟蕾, 赵海平, 郑波. 多囊肾合并囊肿的多重耐药菌感染一例并文献复习[J]. 中华临床医师杂志(电子版), 2023, 17(08): 920-923.
[12] 李达, 张大涯, 陈润祥, 张晓冬, 黄士美, 陈晨, 曾凡, 陈世锔, 白飞虎. 海南省东方市幽门螺杆菌感染现状的调查与相关危险因素分析[J]. 中华临床医师杂志(电子版), 2023, 17(08): 858-864.
[13] 卓徐鹏, 刘颖, 任菁菁. 感染性疾病与老年人低蛋白血症的相关性研究进展[J]. 中华临床医师杂志(电子版), 2023, 17(08): 896-899.
[14] 李琪, 黄钟莹, 袁平, 关振鹏. 基于某三级医院的ICU多重耐药菌医院感染影响因素的分析[J]. 中华临床医师杂志(电子版), 2023, 17(07): 777-782.
[15] 杨艳丽, 陈昱, 赵若辰, 杜伟, 马海娟, 许珂, 张莉芸. 系统性红斑狼疮合并血流感染的危险因素及细菌学分析[J]. 中华临床医师杂志(电子版), 2023, 17(06): 694-699.
阅读次数
全文


摘要